在等溫模式下相對(duì)于設(shè)定溫度的孔間準(zhǔn)確性；

　　在溫度轉(zhuǎn)換后相對(duì)于設(shè)定溫度的孔間準(zhǔn)確性；

　　熱蓋溫度的準(zhǔn)確性。

　　引物退火溫度控制：

　　梯度溫度控制是PCR儀一項(xiàng)有助于PCR中引物退火優(yōu)化的功能。梯度設(shè)定的目的是在模塊之間實(shí)現(xiàn)變化的溫度，通過(guò)每列之間≥2°C的溫度升降，可同時(shí)對(duì)于不同溫度進(jìn)行測(cè)試以獲取引物退火溫度。理論上，梯度可在模塊之間實(shí)現(xiàn)線性的溫度。

　　然而，傳統(tǒng)梯度PCR儀通常采用單一的熱模塊并通過(guò)位于兩端的兩個(gè)加熱及冷卻元件進(jìn)行溫度的控制，經(jīng)常會(huì)導(dǎo)致以下限制：

　　僅能設(shè)置兩個(gè)溫度：在熱模塊的兩端設(shè)置成引物退火的高、低溫度，無(wú)法在模塊間實(shí)現(xiàn)其他溫度的準(zhǔn)確設(shè)置。由于不同列之間的熱交換，模塊上不同區(qū)域間的溫度更可能遵循的是S形的曲線變化而非線性梯度。

　　三槽梯度PCR儀對(duì)于樣品溫度控制的能力對(duì)于PCR結(jié)果的準(zhǔn)確性十分重要。儀器特異性的參數(shù)如升降溫速度，維持時(shí)間以及算法對(duì)于預(yù)測(cè)樣品溫度是關(guān)鍵。升降溫速度意味著在一定時(shí)間內(nèi)發(fā)生的PCR步驟之間的溫度變化。由于熱量從模塊傳輸至樣品需要一定的時(shí)間，樣品實(shí)際的升降溫速度會(huì)較慢。因此，對(duì)于變溫速度的定義需要進(jìn)行區(qū)分和了解。